Les premiers S.O.S. Fantômes décident de prendre leur retraite et de confier leur entreprise de chasse aux fantômes à leurs fils. Lorsque leurs pères sont kidnappés par les fantômes de Prime Evil, Jake et Eddie doivent surmonter leurs peurs et se lancer dans la chasse aux fantômes plus tôt que prévu en se rendant dans le futur.