Lockon a été sévèrement blessé en protégeant Tieria lors de la confrontation avec les nouveaux MS à réacteurs solaires, les GN-X. Ceux-ci, après leur échec contre le Ptolémée, décident d'en découdre une bonne fois pour toutes avec les Trinity. Setsuna décide d'intervenir et découvre un nouveau système hérité d'Aeolia Schenberg lui-même.